窑沟乡位于清水河县西南部黄河边上，距县城35公里，北邻王桂窑乡，西与准格尔旗隔河相望，东南与单台子乡接壤。全乡总面积242平方公里，南北长31公里，东西宽8公里。黄河流经窑沟乡14个自然村，后因万家寨水利枢纽工程建设，境内黄河水位上升，淹没窑沟乡3个自然村，随着万家寨水库的建成和沿河一带小流域生态建设，沿河一带兴起发展旅游业和网箱养鱼，成为该乡一道亮丽的风景线。
　　窑沟乡现与原小缸房乡合为一乡，共辖18个村委，108个自然村，总户数4832户，总人口17187人，无少数民族居住。全乡公路“二横八纵”，“二横”即109国道和黄河公路自北向南横穿窑沟乡全境，“八纵”即由东向西的八条乡村公路将109国道和黄河相连接，形成四通八达的公路网络。乡境内矿产资源比较丰富，有煤炭、高土、陶土、石灰石、铝土、铁矿、白泥、花纹石等。